第二年开春，大明朝按照节奏平稳开展内部建设，除了福建沿海战旗蔽天之外，其他的一切如常。
内耗了一年的清朝，政局也稳定了下来，新任命索尼为议政大臣、总管内务府，苏克萨哈为领侍卫内大臣，遏必隆授一等公、内大臣，鳌拜授一等公、议政大臣。四人均是一等公，协助皇帝处理政务。
此时的草原上也陷入平静，因为在葛尔丹西北边的哈萨克汗国和西南的和硕特汗国与准格尔部起了摩擦，所以他不得不带兵西归。
西归后的葛尔丹率骑进攻哈萨克的头克汗，头克汗用计诱葛尔丹军入城，待雪夜哈萨克援军一到，内外夹击，准噶尔骑兵猝不及防，马匹陷入雪坑，死伤过半。葛尔丹第一次西征失利，但是这次失败，并没有影响葛尔丹大军的锐气，不久，葛尔丹再发兵，攻下塔什干、赛里木等城市，准噶尔骑兵一直西进占领了费尔干纳，至此西征取得大胜。
接着为了实现统一蒙古的夙愿，葛尔丹又率领大军南下攻占了和硕特汗国（包括青海、西藏），葛尔丹也将牙帳设在了伊犁。
这一时期的葛尔丹为了防备清军，多次派使者到沙俄，希望沙俄能够牵制清军，而沙俄也为了通过葛尔丹，加强在我国西北和东北地区，积极派使者与葛尔丹联络。
在这期间清朝由于要恢复元气，并没有主动发起过大的边境战争，明朝则在福建沿海囤积大军，发起了收台之战。第二艘铁甲战船也按计划提前入列，命名为威远号，编入福建水军，归郑成功指挥。
威远号的吨位虽然没有达到振兴号的两倍，但是作战能力是振兴号的两倍以上，所以最初制定的平台方案被改变，海战由施琅指挥振兴号、威远号进行，对台湾岛海域南北实施海禁，陆战则按之前的计划由郑成功率领海军陆战队进行，从台中、台南两处登陆，逐渐收复整个台湾。
高一鸣收到福建调整海战方案的请示，当即批复同意，同时授姚启圣、郑成功、施琅三人临机专断之权，遇有解决不了的事情，三人商议解决，以免贻误战机，战后向朝廷奏明就行，不过他要求六月之前，最好是在四月末到五月上旬收复台湾。
“姚老师，您素来惯于揣摩上意，您来说说，皇上为什么要让我们四月末五月上旬收台。”
“施琅啊，以前姚老师让你好好读书，你总是不以为然，这就不知道了吧。”
“姚大人又卖关子啦。”
“听这话的意思，郑大人似乎知道皇上的用意？”
“知道的不多，我说一说，请姚大人给指点指点？”
“指点不敢当，请讲。”
“如今葛尔丹忙着在西部用兵，清军呢虽然之前连续败给葛尔丹，但是主力尚存，皇上这是为了防止清军突然南下，而我们又不能尽快结束收台之战，使朝廷陷于两线作战的境地啊，不知道和姚大人所想是否相同。”
“哈哈！难怪郑大人年纪轻轻就被皇上赋予重任，战略眼光和战术头脑你是一样不缺，多加磨炼，不难成为大将之才，此等才能我只在当今皇上和秦良玉、高杰、李定国三位将军身上见过。”
“姚大人谬赞了，我如何敢和秦老将军以及李定国、高杰两位大帅相比，更不敢和皇上相提并论。”
“呵呵，是老朽失言了，不过你也不必过谦。”
“姚老师还是那么爱说，看人从没准过。”
“嗯！施琅这话不假，就说施琅，小时玩劣，都被我逐出师门了，谁能想到，这家伙弃文从武之后居然成就一番大才，如今也是指挥千军万马的将军了。”
“你们师徒俩啊，不管如何，皇上授予了我们临机专断之权，那收台之战就是志在必得，我们商议一下出兵事宜吧。”