如教廷所知，葡萄牙殖民者在东非的大溃败用一泻千里来形容都太保守了。哪怕抛开现任总督摆烂避战不谈，曼努埃尔本人在果阿海战后对印度的热情就一落千丈了，于震惊之后清醒过来的葡萄牙宫廷上下都一致认为穆斯林的实力被远远低估了，在印度发的横财只是过眼云烟。
自认为上承天命的曼努埃尔经过思考认为——天主是在用这种方式提醒他葡萄牙的使命不在于光复圣地、摧毁天方世界，而是在已知世界之外不断地拓展基督教的神圣边界。
强硬派军官因而惊讶地得知阿尔贝加里亚的请求被里斯本批准了！他们被命令完全放弃在好望角以东的一切据点，将船只、人员和财物尽可能多地撤到几内亚待命，甚至部分船只还要将枪炮弹药全部转交给巴西的新据点。
先乘一艘卡拉克船至蒙巴萨火速上任的侯赛因轻轻松松地就将他的辖区南扩至索法拉，并以通敌的罪名处决了被抛弃的葡萄牙傀儡、通缉基尔瓦王室其余分支，并赦免各港口协助异教徒侵略的罪过。
如此行为正式地向斯瓦希里海岸各邦宣告了基尔瓦苏丹国的灭亡，自称的“设拉子人”被真正的“设拉子人”彻底取代。葡萄牙人已经在短暂的统治中证明了这个傀儡王室卵用没有，不是王室成员相互内斗就是和地方势力闹出要屠城的矛盾，用户体验完全可以用差评如潮形容。
斯瓦希里总督如实呈报了他所取得的胜利，在奏报中感谢萨法维舰队先前的军事行动，并简要地阐述他的施政计划。
经过一番探察，侯赛因决定将总督驻地定在桑给巴尔岛，不仅能够杜绝来自内陆各部落、王国的军事威胁，并且他认为岛上的本地势力相较于已有的大港埠较弱，更方便主官施政建设。
桑给巴尔岛的石城正好是一处天然良港，当地尚未完工的葡萄牙设施连同设计草图都被顺利接收。侯赛因认为葡萄牙人原来的建设计划太小气了，若是让世人得知沙赫的总督在这样的小破木堡内办公有损威严。
岛上的石城要修，各城邦的城堡和商栈也要继续建，总督在报告中化身包工头大建特建，这些城堡还要按规格一一安排二百至五百人的常备驻军及相应的武备，以及总督直属的一队海军步兵，各项加起来开支不菲。他主动为君排忧解难：“法兰克人仓皇逃窜，在各地遗留下不少可利用的物资，部分工地就连石砖等重要建材都已准备好，只需征调本地劳工即可把他们留下的木头城堡扩修成属于您的宏伟堡垒。”
火器和火药是一定得从本土输送过去的，海军步兵却大可不必，他动笔批示道：“我认为可以在石城择处修建训练场，以骨干力量训练津芝、印度士卒，如此可事半功倍。”
在修缮防御工事、补充驻军的同时，侯赛因还打算借助本地商人了解有关于内陆的情况，特别是黄金、象牙等重要商品的有关信息，再加上奴隶和桑给巴尔岛出产的香料，这四类商品的出口将会是伊属东非的主要经济来源。易卜拉欣则想的更远，待萨法维在的东非的统治逐渐稳固，还可以尝试开辟种植园，利用廉价的人力资源生产一些经济作物。
葡萄牙殖民者的贸易垄断政策还导致大量本地商人破产，凭借武力占据优势地位的葡萄牙商人如今不得不和军队一同撤离，留下一片真空。