正如5000竞赛的主题一样，这篇档案给人的感觉就是一个谜题。
各种杂乱的信息不断涌现，观看者抱着探究真相的心阅读到最后，也只能问出一句“为什么？”
为什么以守护人类为己任的基金会，会骤然走上一条毁灭人类的路？
要得到这个问题的答案，得先从文章里把那些潜藏的信息找出来。
第一个关键信息：结尾那张SCP-579的图片。
它看起来除了黑色什么也没有。
这似乎是理所当然的，因为“SCP-579-[数据删除]”就是这样一个有效信息都被[数据删除]的项目。
然而只要把这张图的饱和度调高，一些极不显眼的色块就会在图片边缘出现。
那里面隐藏着一段对话——
我颤抖着拿着文件的双手。“确定是吗？”
他点了点头。“我们昨天收到了PNEUMA（灵魂）成员的报告。每个人都是。”
“连我们也是？”
“连我们也是，Tejani。没想到有朝一日我也会赞成这个该死的蜥蜴……”
“那我们该怎么办？”
“你知道我们该怎么办。在我们开始动手前，我想，我们必须散布解药。否则它会出手制止我们的。”
“上帝保佑我们，一。”
“别这样，Tejani。那是‘它’在说话。”
——在作者的设定中，Tejani是道德伦理委员会的主席，“该死的蜥蜴”是大名鼎鼎的SCP-682，而“一”则显然指代O5-1。
这是发生在基金会最高层之间的秘密对话，揭开了谜题上的第一层面纱。
在对人类潜意识的探索当中，他们发现了某种东西。
某种存在于每个人内心的东西：“它”。
682痛恨“它”，所以682痛恨“人类”。
基金会决定动手。
在那之前，他们散布了解药，那就是在12月22日下发的第二份文件。
这也是Dr.Bright会感觉那是某种“释放”的原因。
随后，从“它”的影响下挣脱出来的基金会，开始了毁灭全人类的征程。
那么下一个问题，为什么基金会要毁灭全人类？如果是因为“它”已经侵蚀了全人类，不能给全人类使用解药吗？
我们展开第二个关键信息：档案最后的隐藏文字。
“你刚说入侵，对吧？或许不会再有多少次了。”
“这不是什么几小时就能接受的东西，伙计。你能安静个一分钟吗？我当然不行。不，还不行。被入侵的感觉。”
“我一直在想，就，既然我们已经发现了这些，那还是结束一切为好。这又能花多少时间？但并不是这样。我的一切。你知道他们会怎么说。”
“我觉得恶心。”
依然是两个人的对话，这次对话者的身份不明，但是“他觉得恶心”。
他觉得什么恶心？
是那个入侵人类潜意识的实体？还是这种入侵的行为？还是人类本身？
这实际上并不重要。
因为对682来说，“人类”当中有“它”，“人类”和“它”都足够恶心。
获得了解药之后的基金会成员，拥有了跟682相似的思维。
就像Pietro在GOC的数据库里发现的那份记录，两个GOC成员审讯了一个基金会特工，特工的回答和682档案中的审讯记录如出一辙。
他/它说：“……令人作呕。”
人类的灵魂、思想、意识，或者别的什么，被那东西入侵了，污染了。
人类令人作呕。